提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
(文图:赵筱尘 巫邓炎)
[责编:天天中]
阅读剩余全文()
视觉焦点
土超劲旅大巴遭遇车祸捷克国脚离世 前鲁能外援受伤
窦骁何超莲谈个恋爱,奚梦瑶却发微博辟谣
推荐阅读
彩神必赚方案中国制造 | 这座中国建水电站被印上了非洲纸币
2024-06-20
彩神下载29日在售高收益银行理财产品
2024-09-03
彩神走势图 智慧栽实控人突遭拘留
2024-03-06
彩神官方网站研究:猫能听懂自己名字 看来理不理你是另外一回事
2024-05-10
彩神交流群 起始亦是终:《复联4》为什么看不起其他时间旅行电影
2024-10-15
彩神代理今年北京百校将加入集团化办学
2024-04-02
彩神平台 继王者荣耀后,腾讯又出现象级手游?模仿国外大作让死宅走出家门
2024-06-30
彩神邀请码监管华为多年 英国这一决定耐人寻味
2024-08-09
彩神规则古人是如何控制贫富悬殊的?
2024-03-29
彩神客户端爱彼迎频遭投诉折射管理漏洞 对房东难有约束力
2024-05-18
彩神下载app走深走实 行稳致远(钟声)
2024-09-09
彩神官网网址开始撤离?亚马逊中国网站访问出现异常
2024-06-10
彩神app 新生儿的乳头千万别挤
2024-06-26
彩神登录俄电台将播乌总统8年前主持的魔术节目 网友嘲讽
2024-08-09
彩神官网今年至少1亿人拥有电子社保卡
2024-09-14
彩神注册临沂商城奋斗模式火力全开
2024-12-08
彩神充值4S上调金融费用奔驰:管不了
2024-10-12
彩神手机版金毛直立行走爬楼梯引争议 网友:主人太无知
2024-09-18
彩神计划更具诚意和性价比,2019款领克01试驾
2024-09-22
彩神网投劫匪开皮卡撞破大门 盗取ATM机后扬长而去
2024-07-24
彩神技巧赵丽颖微博取关前经纪人黄斌
2024-07-07
彩神app下载火箭整体进攻打得非常差劲
2024-09-09
彩神软件自称“大学生”兼职招嫖,这款热门交友软件下架整改
2024-11-04
加载更多![](/t2/images/1.gif)
彩神地图